ChromaTOF TileAnalyse des données GCxGC-TOFMS : Transformez vos données en chimie

La taille des données GCxGC peut rapidement devenir importante. Plusieurs listes de milliers d’analytes peuvent nécessiter des mois d’exploitation minutieuse pour trouver les différences infimes entre les ensembles de données, et même ces résultats sont entachés de faux positifs provenant de la variation chromatographique normale.

ChromaTOF Tile révolutionne la façon dont les données de GCxGC sont analysées. Ce logiciel compare les fichiers de données de GCxGC rapidement et facilement. Les différences statistiques significatives ressortent et vous pouvez passer moins de temps à trouver les différences et plus de temps à découvrir ce qu’elles signifient.

« ChromaTOF Tile est une technologie à fort potentiel qui a réduit notre temps de collecte le plus important de 10 jours à 10 minutes. Nous comparons maintenant des groupes d’échantillons riches en pics provenant d’études complexes qui auraient auparavant nécessité des solutions complexes et personnalisées. »

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Conçu pour la comparaison de groupes d’échantillons

En option, des cartes thermiques sont incorporées dans toute l’interface pour donner un aperçu visuel instantané des intensités relatives. ChromaTOF Tile détecte les différences entre deux ou plusieurs classes d’échantillons, telles que : les biomarqueurs différenciant un porteur sain d’un porteur malade ; la détection des mauvaises odeurs dans les échantillons alimentaires qui ont réussi ou échoué au contrôle qualité ; les échantillons d’eau en amont et en aval d’une source d’écoulement ; les échantillons de pétrole de diverses origines géographiques ; et tout ce que vous pouvez imaginer.

Caractéristiques

  • ChromaTOF Tile est un produit distinct et autonome à utiliser avec ChromaTOF.
  • Tous les tableaux et graphiques de l’interface sont exportables pour un reporting plus efficace et pour vous permettre d’obtenir plus de vos données.
  • Des spectres de recherche propres dans la bibliothèque sont générés à partir du processus de mosaïque.
  • Les zones des mosaïques sont utilisées pour quantifier approximativement les tendances dans les échantillons.

Principe de fonctionnement

Le problème : la comparaison d’ensembles de chromatogrammes peut être un processus fastidieux et long. Avec la nécessité de compenser le désalignement chromatographique et de compter des milliers d’analytes, même l’identification automatique des échantillons peut prendre des jours, des semaines, voire des mois. Nos clients nous ont demandé de leur fournir un moyen d’accélérer l’analyse des données.

La solution : en utilisant les données clients, c’est-à-dire de vrais échantillons, nous avons cherché une solution. En concertation avec le Dr Robert Synovec, nous avons constaté que si nous utilisions les ratios de Fisher, nous pourrions partitionner les données en un ensemble de régions (« mosaïques ») et comparer les données régionalisées (« en mosaïque »), plutôt que chaque pixel individuel.

Interface application ChromaTOF Tile

Après avoir fait la moyenne des valeurs d’une région, notre logiciel ChromaTOF Tile compare deux régions correspondantes pour évaluer la valeur de la différence entre ces régions. Présenté sous forme graphique, le logiciel fournit aux utilisateurs des indicateurs de variance faible à élevée entre les régions.

Ces cartes thermiques graphiques attirent rapidement et facilement les yeux des utilisateurs vers les zones de forte variance ou d’intérêt élevé, ce qui réduit le temps que vous passez à rechercher des données aberrantes. Visuellement, vous pouvez voir où se trouvent les différences et savoir quelles données vous devriez regarder pour vos comparaisons.

Interface application ChromaTOF Tile avec cartes thermiques

ChromaTOF Tile ne modifie pas les données fournies. En comparant des mosaïques au lieu de pixels, le système peut réduire les indicateurs de décalage d’alignement pour ne mieux montrer que les différences significatives entre les ensembles de données.

Utilisateur actuel de ChomaTOF ?

Afficher des ressources utiles pour utiliser et maîtriser le logiciel GCxGC robuste.

« Mon groupe de recherche et moi-même à l’université de Washington à Seattle sommes ravis de voir nos recherches se concrétiser dans ChromaTOF Tile. Nous prévoyons que la communauté des utilisateurs de GCxGC bénéficiera grandement de cet outil d’analyse de données pour relever les nombreux défis découlant de l’analyse supervisée d’ensembles de données complexes. »

Robert E. Synovec, professeur de chimie, université de Washington

« Avec des méthodes analytiques de pointe comme la GC 2D TOFMS intégrale, il est simple de générer beaucoup de données, mais ce n’est qu’avec le logiciel ChromaTOF Tile que nous pouvons les traduire en informations et connaissances significatives.

Hans-Gerd Janssen, responsable scientifique Unilever Research, professeur de chimie analytique fondée sur la reconnaissance, Université de Wageningue ; et Ed Rosing, scientifique spécialisé dans l’analyse des saveurs, R et D Unilever

« Dans la science des aérosols, nous nous intéressons généralement aux différences entre plusieurs ensembles d’échantillons pour, par exemple, comparer différentes sources ou régimes de vieillissement atmosphérique. Pour cela, ChromaTOF Tile s’est rapidement avéré être un outil très pratique et simple pour l’évaluation de données de GCxGC complexes. »

Elena Hartner, doctorante, centre conjoint de spectrométrie de masse, université de Rostock et Helmholtz Zentrum München

« Lors de la réalisation d’études de découverte de biomarqueurs, les données biaisées (comme les effets de lots) peuvent vous envoyer sur la mauvaise voie. Les capacités PCA de ChromaTOF Tile sont un moyen rapide et puissant de voir la structure de vos données, y compris les biais inhérents qu’elles présentent. Cela donne aux utilisateurs la possibilité de corriger ces mauvaises directions avant ou après les analyses statistiques, ce qui rend les biomarqueurs présumés plus robustes. »

Heather D. Bean, professeure assistante, School of Life Science, Arizona State University
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